Добыча углеводородного сырья связана с серьёзным вмешательством в окружающую среду. Бурение скважин, строительство шахт нарушает целостность литосферы, загрязняются и деградируют почвы вокруг работающего месторождения. Пустоты, которые образуются в литосфере в результате извлечения углеводородного сырья, приводят к обвалам породы.
В процессе извлечения углеводородного сырья образуются загрязнённые углеводородами жидкие и твёрдые отходы (пластовые воды, пустая порода). Для хранения отходов нужны огромные площади, изъятые из фонда земель сельскохозяйственного назначения.
Добыча углеводородного сырья нарушает привычную жизнь птиц и животных, вынуждает их покидать привычные места обитания.
Аварийные разливы нефти приводят к загрязнению почв и водоёмов, погибают рыбы, птицы, водная растительность.
Современное экологическое законодательство обязывает добывающие предприятия бережно относиться к окружающей среде, внедрять малоотходные технологии переработки добытого сырья, проводить рекультивацию территории после завершения процесса добычи сырья, вносить плату за природопользование.