Комбинативная изменчивость обусловлена образованием комбинации генов, которые отсутствовали у родителей. Существуют источники, действующие независимо и одновременно, обеспечивающие постоянную «перетасовку» генов, приводящую к появлению организмов с другими генотипом и фенотипом:
независимое расхождение гомологичных хромосом в анафазе первого деления мейоза;
взаимный обмен участками гомологичных хромосом (кроссинговер) в профазе первого деления мейоза. При этом создаются новые группы сцепления;
случайное сочетание гамет при оплодотворении.