В природном отношении Западная Сибирь разделяется на две части: Западно-Сибирскую равнину и Алтайские горы.
Западно-Сибирская равнина – одна из самых обширных низменных равнин суши. Расположена на плите молодой платформы с многокилометровым осадочным чехлом. Рельеф плоский, с понижением к центру. В северной половине распространена многолетняя мерзлота. Медленное течение рек (Обь с притоками) в сочетании со слабым испарением ведут к обилию болот. С севера на юг сменяют друг друга тундра, лесотундра и таёжная (лесоболотная) зоны.
Южная часть Западно-Сибирской равнины, в противоположность северной, отличается засушливостью. Здесь раскинулись лесостепи и степи, много солёных озёр (Чаны, Кулундинское).
Алтайские горы – самая высокая горная система Сибири (г. Белуха – 4506 м). Это древние горы (одного возраста с Уралом), богатые полезными ископаемыми. Несколько участков (в т. ч. район Телецкого озера) внесены в список Всемирного наследия.
Природные богатства Западной Сибири: колоссальные запасы нефти и природного газа в осадочном чехле Западно-Сибирской равнины, уголь и рудные ресурсы Алтая, запасы соды и солей в степных озёрах, чернозёмные почвы, кедровые леса.