В настоящее время таксономия высших споровых растений вызывает вопросы. Среди папоротникообразных выделяют от 1 до 4 отделов (папоротниковидные, хвощевидные, плауновидные, псилотовидные), иногда понижая ранг некоторых из них до классов.
Группа Папоротниковидные включает три вымерших группы: риниевые, кладоксилеевые и зигоптериевые и четыре современных: псилотовые (близки к примитивным растениям), ужовниковые, мараттиевые и настоящие папоротники.
Значение папоротников:
молодые листья употребляются человеком в пищу;
выращиваются в качестве декоративных растений;
используются в медицине для производства лекарств;
древние папоротникообразные образовали залежи каменного угля.
Группа Хвощевидные включает один современный класс хвощовые, один порядок хвощовые и одно семейство хвощовые.
Группа Плауновидные включает семейства плауновые, селагинелловые, полушниковые, баранцовые.
Значение плаунов:
могут использоваться в пиротехнике;
используются в медицине и технике как обсыпка (натуральный тальк);
служат для производства синей, жёлтой и зелёной краски.