Кровеносная система птиц замкнутая, сердце четырёхкамерное, из левого желудочка выходит правая дуга аорты. Два круга кровообращения. Артериальная кровь отделена от венозной. Птицы – теплокровные животные.
Органы дыхания – губчатые лёгкие с лёгочными мешками. Для птиц характерно двойное дыхание.
Пищеварительная система включает рот, глотку, пищевод, зоб, желудок, кишечник, клоаку. У птиц отсутствуют зубы, у некоторых редуцирован желчный пузырь.
Органы выделения – тазовые почки, мочевой пузырь отсутствует. Почки выделяют мочевую кислоту.
Кости полые, многие из них срослись (цевка, череп, все отделы позвоночника, кроме шейного). Грудина образует вырост – киль – для прикрепления летательных мышц. Наиболее развиты грудные и подключичные мышцы.
Головной мозг птиц состоит из 5 отделов. Включает крупные полушария переднего мозга без извилин, хорошо развитые зрительные бугры среднего мозга, мозжечок с бороздами и извилинами.