- Классификация водорослей вызывает много споров: разные авторы относят те или иные водоросли к разным царствам эукариот (за исключением сине-зелёных водорослей, которые относятся к прокариотам).
- В настоящее время выделяют:
- зелёные и харовые водоросли (растения);
- красные и глаукофитовые водоросли (растения либо хромисты);
- охрофитовые (бурые, жёлто-зелёные и золотистые);
- диатомовые, динофитовые, криптофитовые водоросли (протисты либо хромисты, реже растения);
- эвгленовые водоросли (протисты, растения либо животные).
